所有的无色素性脑膜肿瘤都在鉴别诊断之列,因这些肿瘤都有可能是黑色素瘤,尤其那些呈片状排列、核形态一致、有明显核仁的肿瘤。一旦用免疫组化和电镜证实是黑色素瘤,则需要鉴别是原发性还是转移性。然而,转移至脑的黑色素瘤大多是在脑实质内,而不在脑膜。但要确定是转移性肿瘤,还需结合临床病史和影像学检查。
黑色素瘤与良性黑色素细胞瘤的鉴别,根据组织形态学较为容易,困难的是处于两者中间中等级别的黑色素细胞瘤。尽管不是所有的病例都能明确鉴别,但要强调黑色素瘤细胞不典型性和核分裂多,并有局部坏死这些恶性特征。呈巢状、上皮样细胞学特征、低Ki67指数、小叶周围IV胶原和层黏蛋白沉积都有利于黑色素细胞瘤的诊断。